Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms