Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcal1Q8BJL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms