Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srgap3Q812A2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srgap3Q812A2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms