Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otop3Q80UF9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otop3Q80UF9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms