Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube3cQ80U95 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms