Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf139Q7TMV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms