Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znrd1Q791N7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znrd1Q791N7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms