Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed3Q78IS1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed3Q78IS1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms