Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GypcQ78HU7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GypcQ78HU7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GypcQ78HU7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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