Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm3bQ6ZPY7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm3bQ6ZPY7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm3bQ6ZPY7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms