Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcp4l1Q6W8Q3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms