Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc1Q6TDU8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casc1Q6TDU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc1Q6TDU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms