Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NesQ6P5H2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NesQ6P5H2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms