Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rprd2Q6NXI6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms