Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn11Q6J756 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms