Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nop58Q6DFW4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nop58Q6DFW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms