Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms