Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nhlh2Q64221 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh2Q64221 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms