Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr2kQ63871 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr2kQ63871 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms