Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ndufa4Q62425 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ndufa4Q62425 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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