Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3a2Q62203 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms