Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrc1Q61830 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrc1Q61830 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrc1Q61830 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrc1Q61830 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms