Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsg1aQ61495 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dsg1aQ61495 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms