Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tfap2bQ61313 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tfap2bQ61313 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms