Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tsr1Q5SWD9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tsr1Q5SWD9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms