Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sft2d1Q5SSN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms