Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xkr9Q5GH62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xkr9Q5GH62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms