Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E330034G19RikQ3UWX6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms