Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm27235Q3UW50 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm27235Q3UW50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm27235Q3UW50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm27235Q3UW50 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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