Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Thsd4Q3UTY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Thsd4Q3UTY6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms