Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BB287469Q3UT53 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms