Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms