Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln5Q3UMW8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cln5Q3UMW8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms