Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam35aQ3UEN2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam35aQ3UEN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms