Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gse1Q3U3C9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gse1Q3U3C9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms