Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sec24aQ3U2P1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms