Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prr27Q3SYJ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms