Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hddc2Q3SXD3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms