Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col24a1Q30D77 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col24a1Q30D77 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms