Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps8Q0P5W1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps8Q0P5W1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms