Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms