Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp2Q08652 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms