Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb2Q08331 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb2Q08331 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb2Q08331 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms