Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms