Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col17a1Q07563 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col17a1Q07563 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms