Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah1bQ06985 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms