Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrx2Q06348 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrx2Q06348 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms