Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms