Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thbs3Q05895 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Thbs3Q05895 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thbs3Q05895 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms