Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfiaQ02780 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms